大家都知道新任首輔孫承宗在督師遼東的時候就和王在晉有矛盾，直接彈劾將王在晉去職，不過這個時候，孫承宗也沒有多說什么，認可了這個認命，也有人說，孫閣老帶兵入京回援，手握重兵，身為帝師，拜為首輔，而且管兵部事，比起當年張江陵張居正都的權(quán)勢都絲毫不差，也該有個不和的王在晉牽制些。