從崇禎十六年開始，東宮系統(tǒng)就有了軍旗和將旗相區(qū)別的端倪，到了崇禎二十年大軍入遼平虜?shù)臅r候，軍旗已經(jīng)形成了體系。各戰(zhàn)斗編制的旗幟有了等級區(qū)分，其中赤底金龍旗就是方面軍的旗幟，一個方面軍只有這么一面旗，代表至高無上的皇權(quán)。