重新編制之后，最高統(tǒng)帥部旗下將設遠東軍區(qū)、華南軍區(qū)、華中軍區(qū)、華北軍區(qū)以及華西軍區(qū)、東亞遠征軍司令部、東南亞遠征軍司令部、中東軍遠征司令部。因為華南、華中以及華西地方現(xiàn)在以及將來都不可能有對外作戰(zhàn)任務，這些軍區(qū)除華中和華南多設一個內河或者近海艦隊，華西將只保留一個陸軍集團軍、一個空軍司令部的編制。最高統(tǒng)帥部的構想中，遠東軍區(qū)將主要應對蘇俄方面可能出現(xiàn)的威脅，而華北軍區(qū)將負責光復東北三省以及出征朝鮮；東亞遠征軍將負責對日本本土用兵；東南亞遠征軍則負責對付東南亞日軍以及可能出現(xiàn)的美軍和英軍；中東遠征軍則負責中東戰(zhàn)事，主要為中東盟國提供保護以及策應東南亞甚至歐洲的戰(zhàn)事。國內暫無戰(zhàn)事的軍區(qū)削減下來的兵力將全數(shù)并入一線軍區(qū)或者司令部，因為最高統(tǒng)帥部有意在最短的時間內解決日本問題，所以東亞遠征軍的實力在原有基礎上得到了極大的提升，其規(guī)模猛增至五個集團軍、三個航空兵團以及兩支艦隊。中東方向雖然暫時并無戰(zhàn)事，但是考慮到在該地區(qū)保持一定的軍事威懾力將有力的緩解東南亞遠征軍的壓力，故保持現(xiàn)有兵力不動。幾大遠征軍中，東南亞遠征軍的實力本來就排在第二位，調整過后依舊如此，而與原來相比，因為最高統(tǒng)帥部將原屬于廣州空軍司令部的兩個陸航師悉數(shù)撥給了白流蘇，其遠距離打擊和突襲能力有所增強，而如果再計算進越南、老撾、柬埔寨、泰國等盟國的武裝力量，其在東南亞地區(qū)將是不容小覷的一個存在。