在簽訂了貸款協(xié)定后，雙方又簽訂了關于雙方地位關系以及各方面事務的補充協(xié)定，莫特自治領接受西北軍政節(jié)度使府領導，但保持自治地位，軍事、外交由西北負責，內政則接受西北指導。雙方全面領地之間的關稅，而外地商品的關稅收入則全部由莫特自治領收入，不向西北上繳分成。莫特武裝力量全面改組，效仿西北徹骨為預備役和正規(guī)軍隊兩種，預備役日常訓練管理由軍務府負責，而正規(guī)軍隊則由新成立的西北軍事聯(lián)席參謀本部直接負責訓練和掌握，所有正規(guī)軍軍費和預備役的訓練補助費用均由西北政府承擔。初步商定正規(guī)軍為五萬騎兵，從現(xiàn)有莫特武裝力量中挑選精銳產(chǎn)生，而預備役軍隊暫設六萬，采取定期訓練、定期服役（主要是承擔莫特自治領的領地內巡邏和日常治安）的方式進行管理，遇有緊急狀況軍務府可直接征召預備役為正式役。