朱慈烺在這段時間里甚至停了報紙摘抄的工作，一方面整頓軍中。督促各降軍改編、委派光復區(qū)地方官員、籌建市舶司和市舶總署、創(chuàng)立皇明法政大學，親自培養(yǎng)法律人才，并且組織人手對《大明律》、《問刑條例》、《明會典》等法典進行解讀、注釋，重修新法。