所謂的菲律賓遺留問題，其實(shí)就是美國不放心將近五萬的美菲聯(lián)軍完全托付給學(xué)兵軍。這五萬余部隊(duì)中，萬余美軍正在臺(tái)南接受學(xué)兵軍臺(tái)灣兵團(tuán)的整編，剩下的將近四萬余美菲聯(lián)軍一部在棉蘭老島接受整編，還有一部則在郭達(dá)的指揮下與本間雅晴的部隊(duì)在菲律賓中部群島展開激戰(zhàn)。根據(jù)美國政府和學(xué)兵軍簽署的結(jié)盟協(xié)定，這些隸屬于遠(yuǎn)東盟軍司令部的美國菲律賓部隊(duì)，養(yǎng)軍費(fèi)用由美國政府出，指揮權(quán)則歸屬于學(xué)兵軍的遠(yuǎn)征第二軍。美國政府當(dāng)初同意建立遠(yuǎn)東盟軍司令部，一方面是因?yàn)槌吠拇罄麃喼繁欢滤溃绻麑W(xué)兵軍不伸出援手的話菲律賓部門就可能全軍覆滅，屬于不得已而為之。另一方面則是希望菲律賓戰(zhàn)場能夠牽制日軍西征艦隊(duì)主力，從而為在澳大利亞籌謀反攻贏得時(shí)間。然而人算不如天算，日軍在綠島海戰(zhàn)之后因?yàn)榭紤]到維系南海運(yùn)輸航線的成本太大，居然收縮了在菲律賓的用兵規(guī)模，相反加強(qiáng)了巴布亞新幾內(nèi)亞攻勢。美國人的禍水東引之策失敗，菲律賓部門的殘余兵力反而成了他們賴以維系巴澳防線的救命稻草。