戶部同時還要管理少數(shù)民族事務(wù)，尤其是在課稅、茶葉貿(mào)易以及婚姻人口方面。做為明朝控制青藏重要國策之一的茶馬交易，也是戶部所管理的重要職司。為了禁止私人販茶，朝廷任命了巡茶御史，還設(shè)立了茶馬司、茶課司以及批驗(yàn)所等衙門。戶部外派的茶馬司駐于西寧、河州、洮州、甘州（此三地在今甘肅）、雅州（今四川雅安）等地，都?xì)w屬戶部管理。