神盾局歷史久遠，其歷史最早可以追溯到幾千年前的古埃及。一位大英雄帶領地球人打退了外星侵略者蟲族，他的盾牌被作為標志，成立一個防范重大威脅的秘密組織。歷代成員包括達·芬奇、伽利略、牛頓等偉大人物；鋼鐵俠的父親霍華德·史塔克和神奇先生的父親納撒尼爾·理查茲也是20世紀時的成員。